La sede El Mortiño se encuentra ubicada a 8 km del sector urbano en la vereda del mismo nombre de la sede, a una altura aproximada de 3.200 msnm. Su temperatura es de 12 grados centígrados, su atracción es la capilla y sitios turísticos, el monumento. Esta sede presta servicios a la población en la vereda mortiño en preescolar y primaria grado de 0 a 5. Se desarrollan proyectos transversales como el proyecto de democracia, huerta casera, proyectos de prevención, proyecto de danzas y deportes, proyecto de recreación y proyecto de lectura.